Araştırmacılar Yapay Zeka Kullanarak COVID-19 Genetik İmzayı Kırdı

31
Covid-19 - Yapay Zeka

Makine öğrenimini kullanarak, Batılı bilgisayar bilimcileri ve biyologlarından oluşan bir ekip 29 farklı COVID-19 DNA dizisi için altta yatan bir genomik imza belirledi.

Bu yeni veri keşif aracı, araştırmacıların COVID-19 gibi ölümcül bir virüsü birkaç dakika içinde hızlı ve kolay bir şekilde sınıflandırmasını sağlayacak – bir pandemi sırasında stratejik planlama ve tıbbi ihtiyaçların harekete geçirilmesi için yüksek öneme sahip bir süreç ve hız.

Çalışma ayrıca COVID-19’un ( SARS-CoV-2 ), Betacoronavirüsün bir alt grubu olan Sarbecovirus gibi yarasalarda kök saldığı bilimsel hipotezini de desteklemektedir.

Bulgular, yeni patojenlerin hızlı sınıflandırılması için intrinsik genomik imzalar kullanılarak Makine öğrenmesi: COVID-19 vaka çalışması , yakın zamanda PLOS ONE’da yayınlandı.

“Ultra hızlı, ölçeklenebilir ve son derece hassas” sınıflandırma sistemi, sınıflandırmayı göstermek ve olası tüm sonuçlardan en iyi şekilde yararlanmak için yeni bir grafik tabanlı, özel yazılım ve karar ağacı yaklaşımı kullanır. Tüm yöntem, test edilen tüm olası sonuçlardan en iyi seçimi göstermek için yeni bir grafik tabanlı, özel yazılım kullanır.

Biyoloji profesörü Kathleen Hill , Waterloo Üniversitesi Bilgisayar Bilimi Bölümü’ndeki diğerleri ile birlikte Bilgisayar Bilimi ve İstatistiksel ve Aktüerya Bilimleri alanındaki Batılı işbirlikçileriyle birlikte çalışma yürüttü.

Makine öğrenme yöntemi, COVID-19 sekanslarının yüzde 100 doğru sınıflandırmasını sağlar ve daha da önemlisi, birkaç dakika içinde 5.000’den fazla viral genom arasındaki en ilgili ilişkileri keşfeder.

“İhtiyacımız olan tek şey kendi içsel sekans paternini keşfetmek için COVID-19 DNA sekansıydı. Bu imza desenini ve mantıksal bir yaklaşımı, bu paterni diğer virüslere olabildiğince yakın eşleştirmek için kullandık ve dakikalar değil saatler, dakikalar, dakikalar içinde iyi bir sınıflandırma seviyesi elde ettik ”dedi.

Bu sınıflandırma aracı, 27 Ocak’ta mevcut olan 29 COVID-19 sekansı dahil olmak üzere 5.000’den fazla benzersiz viral genomik sekansı analiz etmek için zaten kullanılmıştır.

Hill, yeni keşfedilen herhangi bir virüs sekansı COVID-19’u veya başka bir şekilde sınıflandırabilen aracın, bu küresel pandemi sırasında aşı ve ilaç geliştiricileri, ön hat sağlık çalışanları, araştırmacılar ve bilim adamları için araç setinde önemli bir bileşen olacağına inanıyor. ve ötesinde.


Kaynak: “Yeni patojenlerin hızlı sınıflandırılması için intrinsik genomik imzalar kullanılarak makine öğrenimi: COVID-19 vaka çalışması” Gurjit S. Randhawa, Maximillian PM Soltysiak, Hadi El Roz, Camila PE de Souza, Kathleen A. Hill ve Lila Kari, PLOS ONE.

YORUM YAP

Lütfen yorumunuzu giriniz!
Lütfen isminizi buraya giriniz