İnsan Akciğer Hücresinin Hesaplamalı Modeli, COVID-19’a Karşı Hücresel İlaç Hedeflerini Öngörür

09.12.2020
133
A+
A-
İnsan Akciğer Hücresinin Hesaplamalı Modeli, COVID-19’a Karşı Hücresel İlaç Hedeflerini Öngörür

Entegre konak-virüs metabolik modelleme yaklaşımının şematik gösterimi. SARS-CoV-2’nin biyokütle bileşimi, genomik ve yapısal bilgilere dayalı olarak tahmin edilir ve ardından konak hücrenin metabolik ağ modeline yerleştirilir. Bu model daha sonra virüs üretimini destekleyen metabolik akışları ve tedirginliklerin etkilerini tahmin etmek için kullanılır.

  • Tüm virüsler gibi covid-19 virüsü de üreme için ana bilgisayarlarına güveniyor
  • SARS-CoV-2’nin bir insan akciğer hücresindeki stokiyometrik amino ve nükleik asitleri nasıl yakaladığı , Warwick Üniversitesi’nden bilim adamları tarafından hesaplamalı bir model kullanılarak keşfedildi.
  • SARS-CoV-2’yi inhibe eden konukçu tabanlı metabolik tedirginlikleri anlayarak, hızlı, deneysel olarak test edilebilir bir ilaç tahmini üretimi yapılabilir.

SARS-CoV-2’nin Warwick Üniversitesi‘ndeki araştırmacılar tarafından yeniden üretmek için insan konak hücre metabolizmasını nasıl kullandığını anlamak için bir insan akciğer hücresinin hesaplamalı bir modeli kullanıldı. Bu çalışma, virüsün konağı hayatta kalmak için nasıl kullandığını anlamaya yardımcı olur ve virüsün tedavisi için ilaç tahminlerinin yapılmasını sağlar.

Virüsler hayatta kalmak için konakçılarına güvenir, yaşam döngüsünün önemli bir adımı, konakçı hücre içindeki virüs partiküllerinin sentezidir, bu nedenle bu süreci anlamak, virüsün hayatta kalmasını önlemenin yollarını bulmanın anahtarıdır.

Warwick Üniversitesi Yaşam Bilimleri Fakültesi’nden bilim adamları, insan akciğer hücresi metabolizmasının bir bilgisayar modelini kullanarak Covid-19’a neden olan virüs olan SARS-CoV-2’nin stokiyometrik amino ve nükleik asit gereksinimlerini yakaladılar.

Onların modeli, SARS-CoV-2 üremesini inhibe eden, amino asit ve nükleotid biyosentez yollarının yanı sıra merkezi metabolizmadaki reaksiyonları vurgulayan, konakçı tabanlı metabolik tedirginlikleri tanımladı. Aslında, araştırmacılar, bu metabolik bozuklukların yalnızca birkaçının virüs üremesini seçici olarak engelleyebildiğini buldular.

Araştırmacılar ayrıca, bu tür reaksiyonların katalize edici enzimlerinin bazılarının, mevcut ilaçlarla etkileşimler gösterdiğini ve bunun, sunulan tahminlerin gen devre dışı bırakma ve RNA müdahale teknikleri kullanılarak deneysel olarak test edilmesinde kullanılabileceğini kaydetti.

Warwick Üniversitesi Yaşam Bilimleri Fakültesi’nden Profesör Orkun Soyer şu yorumu yapıyor:

“SARS-CoV-2 virüsüne neden olan COVID-19 için stokiyometrik bir biyokütle işlevi oluşturduk ve bunu insan akciğer hücresi genom ölçeğinde bir metabolik modele dahil ettik.”

“Daha sonra, SARS-CoV-2 çoğalmasını konakçının metabolik bakımını engellemeden genel olarak veya seçici olarak engelleyebilen reaksiyon tedirginliklerini tahmin ettik. Öngörülen reaksiyonlar öncelikle glikoliz ve oksidatif fosforilasyon yollarına ve bunların amino asit biyosentez yollarına bağlantılarına denk geliyor.”

Warwick Üniversitesi Yaşam Bilimleri Fakültesi’nden Dr. Hadrien Delattre ekliyor:

Bu sonuçlar birlikte, genel olarak insan hücrelerinde ve spesifik olarak insan akciğer hücrelerinde SARS-CoV-2 üremesinin inhibisyonu için konakçı metabolizmasını hedefleme olasılığını vurguluyor.

İnsan Akciğer Hücresinin Hesaplamalı Modeli, COVID-19'a Karşı Hücresel İlaç Hedeflerini Öngörür 1
SARS-CoV-2 infection

“SARS-CoV-2 ile enfekte olmuş hücreleri ve metabolizmalarını keşfetmek için daha fazla araştırma yapılması gerekiyor, ancak burada araştırmacılar tarafından geliştirilen model, belirli ilaç tahminlerini test etmek için bir başlangıç ​​noktası olarak kullanılabilir.”

Referans: Hadrien Delattre, Kalesh Sasidharan ve Orkun S Soyer, 24 Kasım 2020, Life Science Alliance tarafından “İnsan akciğer hücresi metabolik ağındaki bozulmalar yoluyla SARS-CoV-2’nin üremesinin engellenmesi” .

ZİYARETÇİ YORUMLARI - 0 YORUM

Henüz yorum yapılmamış.