ALTIN 488,66
DOLAR 8,6580
EURO 10,1795
BIST 1.419
Adana Adıyaman Afyon Ağrı Aksaray Amasya Ankara Antalya Ardahan Artvin Aydın Balıkesir Bartın Batman Bayburt Bilecik Bingöl Bitlis Bolu Burdur Bursa Çanakkale Çankırı Çorum Denizli Diyarbakır Düzce Edirne Elazığ Erzincan Erzurum Eskişehir Gaziantep Giresun Gümüşhane Hakkari Hatay Iğdır Isparta İstanbul İzmir K.Maraş Karabük Karaman Kars Kastamonu Kayseri Kırıkkale Kırklareli Kırşehir Kilis Kocaeli Konya Kütahya Malatya Manisa Mardin Mersin Muğla Muş Nevşehir Niğde Ordu Osmaniye Rize Sakarya Samsun Siirt Sinop Sivas Şanlıurfa Şırnak Tekirdağ Tokat Trabzon Tunceli Uşak Van Yalova Yozgat Zonguldak
İstanbul 26 °C
Sağanak Yağışlı

SARS-CoV-2 Hücrelerin içine enfekte etmek ve kopyalamak için “Genetik Origami” kullanıyor

20.11.2020
209
SARS-CoV-2 Hücrelerin içine enfekte etmek ve kopyalamak için “Genetik Origami” kullanıyor

Yeni Keşif COVID-19 Tedavilerine Yol Açabilir. Enfeksiyondan sonra SARS-CoV-2 genomunun şeklinin keşfedilmesi, yeni COVID-19 tedavilerini bilgilendirebilir.

Almanya’daki Justus-Liebig Üniversitesi ile işbirliği yapan Cambridge Üniversitesi’ndeki bilim adamları, SARS-CoV-2 genomunun – COVID-19’a neden olan koronavirüs – konakçı hücrelerin içinde başarılı bir şekilde enfekte etmek ve çoğaltmak için genom origami’yi nasıl kullandığını ortaya çıkardılar.

Bu, COVID-19 ile mücadelede virüs genomunun belirli kısımlarını hedefleyen etkili ilaçların geliştirilmesini sağlayabilir.

SARS-CoV-2, birçok koronavirüsten biridir. Hepsi doğadaki en büyük tek sarmallı RNA genomuna sahip olma özelliğini paylaşır.

Bu genom, virüsün protein üretmesi, bağışıklık sisteminden kaçması ve insan vücudunda çoğalması için ihtiyaç duyduğu tüm genetik kodu içerir.

Bu bilgilerin çoğu, hücreleri enfekte ettiğinde bu RNA genomu tarafından benimsenen 3D yapıda bulunur.

Araştırmacılar, COVID-19 için ilaç ve aşı bulma çalışmalarının çoğunun virüsün proteinlerini hedeflemeye odaklandığını söylüyor.

RNA molekülünün şekli işlevi açısından kritik olduğu için, RNA’nın yapısını bozmak için ilaçlarla doğrudan hedeflenmesi yaşam döngüsünü bloke eder ve virüsün kopyalanmasını durdurur.

SARS-CoV-2 Hücrelerin içine enfekte etmek ve kopyalamak için "Genetik Origami" kullanıyor 1
RNA Yapısı

Yakın zamanda Molecular Cell dergisinde yayınlanan bir çalışmada, ekip, konak hücre içindeki SARS-CoV-2 genomunun tüm yapısını ortaya çıkardı ve genomun çok uzun bölümlerini kapsayan bir RNA-RNA etkileşimleri ağını ortaya çıkardı.

Genom boyunca farklı fonksiyonel parçaların, aralarındaki büyük mesafeye rağmen birlikte çalışması gerekiyor ve yeni yapısal veriler, bunun koronavirüs yaşam döngüsünü etkinleştirmek ve hastalığa neden olmak için nasıl başarıldığını gösteriyor.

Cambridge Üniversitesi Wellcome Trust / Cancer Research UK Gurdon Enstitüsü’nden baş yazar Dr. Omer Ziv, “Koronavirüslerin RNA genomu, ortalama bir viral RNA genomundan yaklaşık üç kat daha büyük” dedi.

Araştırmacılar, daha önce, koronavirüs genomları boyunca uzun mesafeli etkileşimlerin, kopyalanmaları ve viral proteinlerin üretilmesi için kritik olduğunu öne sürdüler, ancak yakın zamana kadar bu etkileşimleri tam olarak haritalamak için doğru araçlara sahip değildik.

Artık bu bağlantı ağını anladığımıza göre, onu terapötiklerle etkili bir şekilde hedeflemenin yollarını tasarlamaya başlayabiliriz.

SARS-CoV-2 Hücrelerin içine enfekte etmek ve kopyalamak için "Genetik Origami" kullanıyor 2
Genom Ribozom

Tüm hücrelerde, genom, ribozom adı verilen moleküler bir makine RNA boyunca bir “dur işareti” sonlandırmasını söyleyene kadar kodu okuyarak çalıştığında yapılan belirli proteinlerin üretimi için kodu tutar.

Koronavirüslerde, ribozomun dur işaretinin önünde sadece %50 oranında durduğu özel bir nokta vardır. Vakaların diğer %50’sinde, benzersiz bir RNA şekli, ribozomun dur işaretinin üzerinden atlamasına ve ek viral proteinler üretmesine neden olur.

Yeni araştırma, bu RNA yapısını ve uzun menzilli etkileşimleri haritalandırarak, koronavirüslerin hücrelerimizi manipüle etmek için proteinlerini ürettikleri stratejileri ortaya çıkarıyor.

Dr. Lyudmila Shalamova, “SARS-CoV-2 RNA’nın birbirinden çok uzak mesafelerdeki bölümleri arasında etkileşimlerin gerçekleştiğini gösteriyoruz ve bu etkileşimleri erken SARS-CoV-2 replikasyonu sırasında meydana geldikçe izleyebiliyoruz” dedi.

Gurdon Enstitüsünde doktora sonrası çalışan ve bu çalışmanın ortak lideri olan Dr. Jon Price, SARS-CoV-2’nin tüm RNA yapısını barındıran ücretsiz, açık erişimli bir interaktif web sitesi geliştirdi.

Bu, dünya çapındaki araştırmacıların virüsün RNA genomunun belirli bölgelerini hedeflemek için ilaç geliştirmede yeni verileri kullanmasını sağlayacaktır.

SARS-CoV-2 Hücrelerin içine enfekte etmek ve kopyalamak için "Genetik Origami" kullanıyor 3
Zika virüsü

Çoğu insan virüsünün genomu, DNA’dan ziyade RNA’dan yapılmıştır. Ziv, Zika virüs genomunu anlamak için konakçı hücrelerin içindeki viral RNA genomları boyunca bu tür uzun menzilli etkileşimleri araştırmak için yöntemler geliştirdi. Bu, SARS-CoV-2’yi anlamak için değerli bir metodolojik temel olduğunu kanıtladı.

Referans: Ömer Ziv, Jonathan Price, Lyudmila Shalamova, Tsveta Kamenova, Ian Goodfellow, Friedemann Weber ve Eric A. Miska, 5 Kasım 2020, Molecular tarafından “SARS-CoV-2’nin kısa ve uzun menzilli RNA-RNA İnteraktomu” Hücre.

Bu araştırma, Cambridge Üniversitesi Gurdon Enstitüsü ve Genetik Bölümünden Profesör Eric Miska grubu ile Justus-Liebig Üniversitesi, Viroloji Enstitüsü, Gießen, Almanya’dan Profesör Friedemann Weber arasındaki ortak bir çalışmadır.

Yazarlar, bu araştırmanın bir bölümünü gerçekleştirmek için uzman laboratuvar olanakları sağlayan Cambridge Üniversitesi Biyokimya Bölümü’nün desteğinden dolayı minnettar.

Çalışma, Cancer Research UK, Wellcome ve Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) tarafından finanse edildi.

ZİYARETÇİ YORUMLARI - 0 YORUM

Henüz yorum yapılmamış.