SARS-CoV-2’den Genetik Materyal – COVID-19 Koronavirüs – Louisiana’dan Arıtılmamış Atık Suda Tespit Edildi

0
22
SARS-CoV-2'nin tespitinde Atık Su Bazlı Epidemiyolojinin rolü. Kredi: Masaaki Kitajima / Biorender

Bir grup bilim adamı, ABD, Louisiana’daki iki atık su arıtma tesisinden Nisan 2020’de toplanan arıtılmamış atık su örneklerinde SARS-CoV-2’den genetik materyal tespit etti.

Atık Su Bazlı Epidemiyoloji (WBE), atık su test edilerek insan popülasyonlarında hastalığın yayılmasının izlendiği bir süreçtir. Çocuk felci ve norovirüs enfeksiyonlarının yayılmasını izlemek için kullanılmıştır. Dünyanın dört bir yanındaki birçok grup, WBE’yi COVID-19’u takip edecek şekilde uyarlamak için yöntemler geliştirmeye çalışıyor. Bu yöntemler kullanılarak Avustralya, İspanya, İtalya, Hollanda ve Japonya’dan gelen belediye atık sularında SARS-CoV-2 tespit edilmiştir.

Science of the Total Environment dergisinde yayınlanan bir makalede, aralarında Tulane Üniversitesi’nden Samendra P.Sherchan ve Hokkaido Üniversitesi’nden Masaaki Kitajima’nın da bulunduğu bir grup araştırmacı, arıtılmamış atık suda SARS-CoV-2 RNA tespitini bildirdi. Güney Louisiana’dan Nisan 2020’de toplanan örnekler. Bu, Kuzey Amerika’da atık sularda virüs tespitine ilişkin ilk rapordur.

Atık suda SARS-CoV-2 RNA tespiti ve Güney Louisiana, ABD’de iki alanda (WWTP A ve WWTP B) onaylanmış COVID-19 vakaları. Daireler, kareler ve üçgenler örnekleme tarihlerini ve örnekleme türünü temsil eder; içi dolu daireler atık suda SARS-CoV-2 tespitini gösterir. Kredi: Samendra P. Sherchan, ve diğerleri, Science of The Total Environment, 30 Haziran 2020

Sırasıyla 244.627 (AAT A) ve 45.694 (AAT B) nüfusa hizmet veren iki anonim atık su arıtma tesisinden Ocak ve Nisan 2020 arasında aylık olarak numuneler toplanmıştır. Örnekler arıtılmamış atık suyu, klorlamadan önce arıtılmış atık suyu ve klorlu atık suları içermektedir. Bilim adamları bu örneklerden SARS-CoV-2’yi şu iki yöntemden biriyle kurtarmaya çalıştılar: ultrafiltrasyon (virüsleri toplamak için son derece ince filtrelerden örnekleri filtreleme) veya adsorpsiyon elüsyonu (numuneyi virüsü bağlayan bir zardan geçirme ve ardından toplama virüsü durulayarak). Geri kazanılan virüs miktarı, SARS-CoV-2’yi test etmek için standart yöntem olan ters transkripsiyon-kantitatif PCR ile belirlendi.

Bilim adamları, toplam 15 örnekten sadece iki örnekte SARS-CoV-2 tespit etti. Virüsler, ultrafiltrasyon ile işlenen numunelerde tespit edildi, ancak adsorpsiyon-elüsyon ile konsantre edilen numunelerde tespit edilmedi. Ayrıca, virüs yalnızca arıtılmamış atıkta tespit edildi, ancak arıtılmış atık su örneklerinin hiçbirinde tespit edilmedi – bu da virüsü ortadan kaldırmak ve / veya yok etmek için standart atık su işlemenin yeterli olabileceğini gösteriyor. Son olarak, virüs yalnızca Nisan ayında toplanan örneklerde tespit edildi (29 Nisan’da AATB A ve 8 Nisan’da AAT B). Örnekleme dönemi boyunca, atık su arıtma tesislerinin hizmet verdiği alanlarda teyit edilen toplam vaka sayısı bu ay en yüksek oldu.

Masaaki Kitajima, Hokkaido Üniversitesi (solda) ve Samendra P. Sherchan, Tulane Üniversitesi (sağda). (Fotoğraflar Masaaki Kitajima tarafından sağlanmıştır). Kredi: Masaaki Kitajima tarafından sağlanan fotoğraflar

Bilim adamları, ultrafiltrasyonun virüsün geri kazanılması için üstün bir yöntem olduğu sonucuna vardı, ancak diğer faktörler virüsün tespitini engelleyebilir. Ancak, bu yöntemin sınırlarını anlamak ve aynı amaç için halihazırda test edilmekte olan diğer yöntemlerle karşılaştırmak için daha büyük numune boyutları üzerinde daha fazla test gereklidir. Genel olarak, COVID-19’un WBE’si için daha iyi virüs konsantrasyon yöntemleri ve virüs tespit yöntemleri gereklidir.

Masaaki Kitajima, “Japonya ve ABD dahil olmak üzere birçok ülkeden SARS-CoV-2 RNA tespitine ilişkin son raporlar, COVID-19 sürveyansı için WBE konseptini doğruladı” diyor. “Umarım COVID-19 WBE çalışmaları, uluslararası işbirlikleriyle küresel ölçekte hızlanır.”

Yardımcı Doçent Kitajima şu anda COVID-19 pandemisinin yayılmasını izlemek için WBE’nin uygulanmasıyla ilgili bir dizi araştırmada yer almaktadır. Bu çabada dünya çapında bir dizi bilim insanı ve araştırma grubu ile işbirliği yaptı ve Japonya’da atık suda SARS-CoV-2’yi ilk tespit eden ekibin bir parçasıydı.

Referans: Samendra P.Sherchan, Shalina Shahin, Lauren M. Ward, Sarmila Tandukar, Tiong G. Aw, Bradley Schmitz, “Kuzey Amerika’da atık suda SARS-CoV-2 RNA’nın ilk tespiti: Louisiana, ABD’de bir çalışma” Warish Ahmed ve Masaaki Kitajima, 30 Haziran 2020, Toplam Çevre Bilimi.
DOI: 10.1016 / j.scitotenv.2020.140621

Bu çalışma, Yönetim Kurulu (LEQSF (2018-21) -rd-a-21) ve Japonya Bilimi Teşvik Topluluğu (JSPS) Ortak Uluslararası Araştırmayı Teşvik Etme (Ortak Uluslararası Araştırmayı Teşvik Etme (B)) tarafından finanse edildi. JP18KK0270).

YORUM YAP

Lütfen yorumunuzu giriniz!
Lütfen isminizi buraya giriniz