Yeni DNA Testi ile Salmonella Gıda Zehirlenmesi Salgınlarının Geliştirilmiş İzlenmesi

25
Salmonella gram negatif, çubuk şeklinde, fakültatif anerobik bakterilerdir. Zhang ve arkadaşları, doğrudan örneklerden hızlı serotiplemenin yolunu açarak farklı Salmonella serotiplerini tespit etmek için hassas ve spesifik analizler geliştirdi. Kredi: Halk Sağlığı İmaj Kütüphanesi, ABD Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezleri, James Archer (2019).

The Journal of Molecular Diagnostics, testin Salmonella’nın alt tiplerini hızlı ve hassas bir şekilde ayırt edebileceğini bildirdi.

Araştırmacılar, farklı örneklerden hızlı serotiplemenin yolunu açarak farklı Salmonella serotiplerini tespit etmek için hassas ve spesifik bir tahlilin geliştirildiğini bildiriyor. Mevcut test yöntemleri üzerindeki bu gelişme, enfeksiyonun kaynağının hızla izlenmesinde kritik bir rol oynayabilir. Rapor, Elsevier tarafından yayınlanan The Journal of Molecular Diagnostics dergisinde yayınlandı.

Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezlerinden (CDC) alınan son veriler, Amerika Birleşik Devletleri’nde Salmonella bakterilerinin neden olduğu gıda zehirlenmelerinin yılda 1.35 milyon enfeksiyona, 26.500 hastaneye yatırma ve 420 ölüme yol açtığını göstermektedir. Bir salgın sırasında, belirli bakteri türlerini tespit etmek için yapılan bir testin hızı ve basitliği, halk sağlığı araştırmacılarının kaynağı izlemesi için önemlidir.

“Bir klinik veya gıda örneğindeki salmonella çok az miktarda bulunabilir ve bu nedenle bunları tespit etmek için çok hassas yöntemler gerektirir. Çoklu çapraz yer değiştirme amplifikasyonu (MCDA), çok küçük miktarlarda DNA’yı hızlı bir şekilde tespit edebilen bir yöntemdir ve ayrıca PCR gibi diğer yöntemlerde gerekli sıcaklıkların döngüsünün aksine, tek bir sabit sıcaklıkta gerçekleştirilir. Bu, basit, hızlı ve hassas bakteriyel tespit testi için iyi bir uyum sağlar. Her ne kadar herhangi bir Salmonella için bir MCDA testi mevcut olsa da, farklı serotipler arasında ayrım yapmaz ”dedi. Yeni Güney Galler Üniversitesi, Sydney, NSW, Avustralya’daki Biyoteknoloji ve Biyomoleküler Bilimler Fakültesi’nden Profesör Ruiting Lan, PhD.

Araştırmacılar, Salmonella’nın yedi serovar (alt tipi) spesifik hedefinin her biri için bir MCDA testi geliştirdi. Bu tahlillerin tümü, 10 kadar DNA kopyasını doğru bir şekilde saptar ve yaklaşık sekiz dakika içinde sonuç verebilir. Önemli olarak, bu analizler özel tespit ekipmanı gerektirmez, klinik veya endüstriyel ortamlarda gelecekteki herhangi bir uygulamayı basitleştirir. Bu yedi serovar spesifik testi mevcut tür testiyle birleştirerek Salmonella saptaması basitleştirilebilir ve hızlandırılabilir.

“Bu çalışmada geliştirilen analizler benzersizdir, çünkü kullanılan gen markörleri binlerce genomun analizine dayanarak seçilmiştir. Böylece, bu belirteçler, kültürden bağımsız tanısal testler döneminde Salmonella serotipinin geleceğine dair kanıtıdır ”dedi.

Salmonella serotiplerini ayırt etmek için kullanılan geleneksel yöntemler, bakterilerin örneklerden büyütülmesini ve daha sonra bunların bir serovar atandıklarını test etmeyi içerir. MCDA testi daha hızlıdır, çünkü önce kültürde bakterilerin büyümesini gerektirmez. Aksine, çok az miktarda Salmonella DNA’sını tespit edebilir.

Yüzlerce Salmonella serovar olmasına rağmen, yazarlar Avustralya’da en sık görülen beş tanesini seçtiler ve bu da o ülkede Salmonella enfeksiyonlarının yüzde 85’inden fazlasına neden oldu. Bununla birlikte, bu serovarlardan en az ikisi aynı zamanda dünyadaki en iyi Salmonella serovarlarıdır, bu nedenle araştırmacılar sonuçların diğer coğrafi bölgeler için geçerli olduğuna inanmaktadır.

Salmonella bakterileri tipik olarak hayvan ve insan bağırsaklarında yaşar ve dışkı yoluyla dökülür. İnsanlara kontamine su veya çiğ veya az pişmiş et, kümes hayvanları, yumurta veya yumurta ürünleri gibi yiyecekler verilerek bulaşabilir. Salmonella zehirlenmesinin olası belirtileri ve semptomları arasında bulantı, kusma, karın krampları, ishal, ateş ve baş ağrısı bulunur.


Kaynak: Xiaomei Zhang, Michael Payne, Qinning Wang, Vitali Sintchenko ve Ruiting Lan, 28 Nisan 2020, Moleküler Diagnostik Dergisi, “Beş Yaygın Salmonella Serovarının Çoklu Çapraz Deplasman Amplifikasyonuyla Yüksek Hassasiyetli ve Spesifik Tespiti ve Serotipi”.

Yeni DNA Testi ile Salmonella Gıda Zehirlenmesi Salgınlarının Geliştirilmiş İzlenmesi 1

YORUM YAP

Lütfen yorumunuzu giriniz!
Lütfen isminizi buraya giriniz